9 июня 2017 года вышел приказ "О переоформлении свидетельства о государственной аккредитации федеральному государственному бюджетному образовательному учреждению высшего образования "Алтайский государственный аграрный университет". В соответствии с этим приказом университет получил  государственную аккредитацию направлений поготовки кадров высшей квалификации по программам подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре по следующим укрупненным групам профессий, специальностей и направлений подготовки профессионального образования:

05.00.00 Науки о Земле,

06.00.00 Биологические науки,

35.00.00 Сельское, лесное и рыбное хозяйство,

36.00.00 Ветеринария и зоотехния.