1943 год. Третьего декабря на базе эвакуированного на Алтай Пушкинского сельскохозяйственного института создан Алтайский сельскохозяйственный институт. Он начал действовать в посёлке Павловск в составе двух факультетов — агрономического и зоотехнического.
1944 год. Институт переехал из Павловска в город Барнаул.
1946 год. Состоялся первый выпуск специалистов Алтайского сельскохозяйственного института в количестве 35 человек (агрономического и зоотехнического факультетов).
1947 год. Открыт факультет заочного образования.
1950 год. Открыты факультет механизации сельского хозяйства и аспирантура.
1957 год. Сдано в эксплуатацию общежитие № 1.
1958 год. Образовано учебно-опытное хозяйство «Пригородное».
1960 год. Вышел первый номер многотиражной газеты «За сельскохозяйственные кадры».
1961 год. Начата подготовка экономистов-организаторов и экономистов по бухгалтерскому учёту.
1962 год. Начата подготовка ветеринарных врачей.
1963 год. Сдан в эксплуатацию главный учебный корпус.
1965 год. Открыт факультет общественных профессий, сдано в эксплуатацию общежитие № 2.
1966 год. Открыт факультет повышения квалификации руководящих кадров колхозов и совхозов и специалистов сельского хозяйства, сдано в эксплуатацию общежитие № 3.
1969 год. Открыто подготовительное отделение.
1977 год. Сдан в эксплуатацию комплекс ветеринарных клиник.
1978 год. Сдано в эксплуатацию высотное общежитие № 4.
1980 год. Начата подготовка инженеров-гидромелиораторов.
1991 год. Алтайский сельскохозяйственный институт преобразован в Алтайский государственный аграрный университет, открыт первый диссертационный совет по защите кандидатских диссертаций.
1998–2008 годы. Открыты 14 специальностей высшего профессионального образования, 12 научных специальностей аспирантуры.
2001 год. В университете появилось своё научное издание — «Вестник Алтайского государственного аграрного университета» (с 2006 года включён в перечень ВАК).
2003 год. Сданы в эксплуатацию корпус № 4 и корпус № 6 экономического факультета, открыта докторантура.
2007 год. Открыта магистратура.
2008 год. Сдан в эксплуатацию корпус № 7 института природообустройства. Утверждены семь диссертационных советов.